جویبار همانند تمام شهرستان‌های مازندران با موضوع زباله درگیر است و حتی در ابتدایی‌ترین مسائل نیز مشکل دارد، جمع‌آوری زباله به صورت سنتی، تجمع زیاد زباله در حاشیه جاده‌ها و خطر افزایش احتمال ورود شیرآبه به اراضی کشاورزی کنار جاده، بخشی از این مشکلاتی است که در این شهرستان وجود دارد.