طبق اعلام وزارت جهاد کشاورزی این ستاد موظف است وضعیت قاچاق محصولات کشاورزی را به طور مستمر رصد کند و راهکارهای مقابله با آن را از طریق مراجع مسئول پیگیری کند و نتایج آن را ماهانه به وزیر جهاد کشاورزی اعلام کند.