وظیفه بورس كالا بسترسازی و فراهم ساختن زیرساخت‌ها است اما از آنجا كه طرح‌های مطرح شده در حوزه كشاورزی، ملی است و دستگاه‌های مختلفی نیز در آن دخیل هستند، لازمه موفقیت طرح، همكاری و هماهنگی همه دستگاه‌ها اعم از وزارت جهاد كشاورزی، سازمان مدیریت و برنامه‌ریزی، وزارت اقتصاد و سازمان‌های زیرمجموعه این وزارتخانه‌هاست.